Observa-se a presença de HPV 6 e 11 em papilomas de células escamosas da córnea e conjuntiva. Quando essas  lesões benignas são recidivantes, é encontrado o HPV 16 (mais oncogênico).

Sabe-se que existe uma região ocular de transição entre o epitélio da córnea e da conjuntiva (limbus), que predispõe a alterações neoplásicas(tumores).

Acredita-se que a infecção ocular pelo HPV ocorra por manipulação de local contaminado da mesma pessoa ( HPV genital masculino e feminino).

A contaminação ocular pode ocorrer durante a gravidez pelo líquido amniótico contaminado ou durante o trabalho de parto em gestantes com lesões genitais.

Existe também a possibilidade de contaminação ocular dos médicos que realizam cauterizações de verrugas genitais sem os cuidados adequados como uso de máscaras e aspiradores de fumaça durante o procedimento.